Thực hiện Luật Xây dựng 2014, Nghị định số 59/2015/NĐ-CP ngày 18/6/2015 của Chính phủ về quản lý dự án đầu tư xây dựng, Thông tư số 16/2016/TT-BXD ngày 30/6/2016 của Bộ Xây dựng Hướng dẫn thực hiện một số Điều của Nghị định số 59/2015/NĐ-CP ngày 18/6/2015 của Chính phủ về hình thức tổ chức quản lý dự án đầu tư xây dựng; Ban Quản lý Khu kinh tế Vân Phong đã thực hiện các thủ tục liên quan và trình UBND tỉnh ban hành Quyết định số 2708/QĐ-UBND  ngày 13/9/2016 về việc thành lập Ban Quản lý dự án hạ tầng khu kinh tế và Khu công nghiệp (viết tắt là BQLDA) trực thuộc Ban Quản lý Khu kinh tế Vân Phong.